毫无疑问，喷墨打印机的核心就是墨水系统。墨水按色基分类为染料型墨（以染料为色基的墨水）和颜料型墨（以颜料为色基的墨水），按溶剂来分类为水性墨（以水和水溶性的溶剂作为溶解色基的主要成分）和油性墨（以非水溶性的溶剂作为溶解色基的主要成分）。水性墨水里面有染料墨和颜料墨，此类墨水ph值一般为中性；油性墨水里面也有染料墨和颜料墨，此类墨水的ph值一般为酸性。因此，水性墨水和油性墨水不能在同一个打印头中混用，油性墨水（包括弱溶剂墨水）一般也不建议使用在桌面机上。目前我们桌面机使用最多的是水性染料型墨和水性颜料型墨，一般称为染料墨水和颜料墨水。

    染料墨水是分子级全溶解的墨水，这种墨水是完全的复合溶液，堵墨头的概率很小，喷绘后易于被材料吸收，色彩艳丽，而且造价成本低，缺点是不防水，并且由于染料分子在紫外线照射下很快分解，导致户外紫外线下使用一个月内就有明显褪色。但是，由于其色彩鲜艳、层次分明且价格也较颜料型墨水低，因此是打印图片、制作彩喷名片等用途的首选产品。

    颜料墨水说得形象点，就是粉状墨水，当然，这只是种形象的说法，并不够准确。准确一点地说，它是把固体颜料研磨成十分细小的颗粒，溶解于特殊的水溶剂中，是一种悬浮溶液或者叫半溶液，跟我们印染衣物的颜料性质同样。与染料墨水渗入到介质再形成色彩的原理完全相反，它是通过色材附在介质（如复印纸或打印纸等）的表面来发色的。因此，用颜料墨水来打印，即使在普通纸上打印也不会洇墨，而且由于颜料本身防水，也不容易被紫外线分解，所以它的耐水性强，也耐光，打印出来的东西即使在户外使用也能维持一年以上没有明显的褪色迹象。不过，大多数的颜料墨水都会因此而使表面残留色材，所以，即使在有光纸等表面平坦的纸上打印也不能打印出有光泽的图像来，这就是为什么一般用颜料墨水打印出来的东西都没光泽的缘故。另外，颜料墨水的制造成本较高，所以售价也较染料墨水贵，其价差高达二至四倍以上。

    在2009年的新品商用喷墨打印机惠普pro8000以及爱普生ME office 80W和ME office 70上，已经完成了由染料墨水到颜料墨水的过渡。而佳能iP4680/iP4500只有黑色墨水使用颜料墨水，彩色墨水仍然是染料。因此在商务喷墨打印机使用颜料墨水的根本原因有两点：一是颜料墨水不容易发生洇墨，二是颜料墨水打印的稳定性更好，这两点恰好的弥补了彩色喷墨打印机相对于激光打印机的两大缺陷。正因为如此，爱普生由于将黑色和彩色墨水全部改为颜料墨，使得打印出来的文字锐利，色泽饱满，可以在普通纸上表现非常好的彩色打印效果，其彩色文本在防水性耐光性等方面更加出色。颜料墨水优异的防水性、抗光性、长久的保存年限特别是对于普通纸上文本打印质量的提升使得它在商务办公领域显得优势突出，而在之后的商务喷墨打印机领域，颜料墨水也会占据绝对主流的地位。

    在打印技术方面，惠普和佳能采用热泡打印技术，爱普生采用微压电打印技术，这使得爱普生在喷头的耐用性方面占据优势。爱普生通常称自己的打印头为永久打印头，同时，爱普生“Bi-ink双黑墨”打印技术的成功研发，帮助ME70完成了一次黑色打印速度上的提速，也具有重要的意义。惠普的打印头作为耗材的形式出现，无论是新品pro8000还是K5400dn中均是如此，用户在使用的时候需要自己安装。惠普SPT技术对于商务应用性能的提升贡献巨大，通过增加打印头的宽度来提升打印速度，在今后，惠普的商用喷墨机仍会以SPT技术为依托。